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유전자군 분석의 방법론과 응용A Method for Gene Group Analysis and Its Application

Other Titles
A Method for Gene Group Analysis and Its Application
Authors
이태원Robert R. Delongchamp
Issue Date
2012
Publisher
한국통계학회
Keywords
Microarray; Gene Ontology; gene group analysis; $p$-value; SAS program.; 마이크로어레이; 유전자 온톨로지; 유전자군 분석; p-value; SAS 프로그램.
Citation
응용통계연구, v.25, no.2, pp.269 - 277
Indexed
KCI
Journal Title
응용통계연구
Volume
25
Number
2
Start Page
269
End Page
277
URI
https://scholar.korea.ac.kr/handle/2021.sw.korea/110039
ISSN
1225-066X
Abstract
마이크로어레이 분석은 특이 발현하는 개별적인 유전자보다 유전자 온톨로지(Gene Ontology)와같이 기능적 분류나 생물학적 경로(pathway)와 관련된유전자군을 찾아내는 것이 그 해석의 용이성 때문에 최근 더욱 많은 연구가 진행되고 있다. 약물 처리에 의한 생물학적 반응을 연구할 때, 한 유전자군에 속하는 유전자들 각각의특이 발현 여부의 유의성을 나타내는 p-value들을 취합하여 그 유전자군의 유의성을 결정하는통계 검증 방법을 본 논문에서 소개하였다. 본 논문에 제시된 유전자군분석(Gene group analysis) 방법은 Fisher's exact test나 permutation test와 같은 기존의대표적인 방법들보다 더 정확하고 적용범위가 넓음을 실재 생물학 실험 자료의 분석을 통해 보였다. 제시된 유전자군 분석 방법은 SAS 프로그램으로 구현되었고 저자의 홈페이지(http://cafe.daum.net/go.analysis)에서 내려 받아 사용할 수 있다.
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